home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00195 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.8 KB  |  59 lines
  1. **************************************
  2. * Annexins repeated domain signature *
  3. **************************************
  4.  
  5. Annexins [1  to 6]  are a   group  of calcium-binding  proteins that associate
  6. reversibly  with membranes.   They  bind   to  phospholipid   bilayers  in the
  7. presence  of micromolar free calcium  concentration.   The binding is specific
  8. for calcium and for acidic phospholipids.  Annexins  have  been  claimed to be
  9. involved in cytoskeletal interactions, phospholipase inhibition, intracellular
  10. signalling, anticoagulation, and membrane fusion.
  11.  
  12. Each of these  proteins  consist  of  an  N-terminal domain of variable length
  13. followed by four or eight copies of a conserved segment of sixty one residues.
  14. The repeat (sometimes known  as  an 'endonexin fold')  consists of five alpha-
  15. helices that are wound into a right-handed superhelix [7].
  16.  
  17. The proteins known to belong to the annexin family are listed below:
  18.  
  19.  - Annexin I (Lipocortin 1) (Calpactin 2) (p35) (Chromobindin 9).
  20.  - Annexin II (Lipocortin 2) (Calpactin 1) (Protein I) (p36) (Chromobindin 8).
  21.  - Annexin III (Lipocortin 3) (PAP-III).
  22.  - Annexin IV (Lipocortin 4) (Endonexin I) (Protein II) (Chromobindin 4).
  23.  - Annexin V (Lipocortin 5) (Endonexin 2) (VAC-alpha) (Anchorin CII) (PAP-I).
  24.  - Annexin VI (Lipocortin 6) (Protein III) (Chromobindin 20) (p68) (p70). This
  25.    is the only known annexin that contains 8 (instead of 4) repeats.
  26.  - Annexin VII (Synexin).
  27.  - Annexin VIII (Vascular anticoagulant-beta) (VAC-beta).
  28.  - Annexin IX from Drosophila.
  29.  - Annexin X from Drosophila.
  30.  - Annexin XI (Calcyclin-associated annexin) (CAP-50).
  31.  - Annexin XII from Hydra vulgaris.
  32.  - Annexin XIII (Intestine-specific annexin) (ISA).
  33.  
  34. The signature  pattern for this  domain spans  positions 9 to 61 of the repeat
  35. and includes the only perfectly conserved residue (an arginine in position 22)
  36.  
  37. -Consensus pattern: [TG]-[STV]-x(8)-[LIVMF]-x(2)-R-x(3)-[DEQNH]-x(7)-[IFY]-
  38.                     x(7)-[LIVMF]-x(3)-[LIVMF]-x(11)-[LIVMFA]-x(2)-[LIVMF]
  39. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL. But the
  40.  pattern will miss some of the repeats of annexin IX, X, XI, and XII.
  41. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: Pseudomonas putida  RNA  polymerase
  42.  beta chain.
  43. -Last update: June 1994 / Text revised.
  44.  
  45. [ 1] Raynal P., Pollard H.B.
  46.      Biochim. Biophys. Acta 1197:63-93(1994).
  47. [ 2] Barton G.J., Newman R.H., Freemont P.S., Crumpton M.J.
  48.      Eur. J. Biochem. 198:749-760(1991).
  49. [ 3] Burgoyne R.D., Geisow M.J.
  50.      Cell Calcium 10:1-10(1989).
  51. [ 4] Haigler H.T., Fitch J.M., Jones J.M., Schlaepfer D.D.
  52.      Trends Biochem. Sci. 14:48-50(1989).
  53. [ 5] Klee C.B.
  54.      Biochemistry 27:6645-6653(1988).
  55. [ 6] Smith P.D., Moss S.E.
  56.      Trends Genet. 10:241-246(1994).
  57. [ 7] Huber R., Roemisch J., Paques E.-P.
  58.      EMBO J. 9:3867-3874(1990).
  59.